最近几年，新疆自治区强力推进棉花质量检验体制改革已取得突破性进展。截至目前，全自治区已在棉花主产区建成17家棉花公证检验室，配置了77台从美国进口的棉花大容量快速检测仪（HVI）。2006年度， 284家加工企业按照要求接受了棉花公证检验，以确保新疆棉的质量符合国内外市场的要求。
2007年8月28日，新疆自治区纤维检验局局长路伟在全区棉花质量监督暨纤维执法打假工作会议上表示，2007年度新疆棉花种植面积为130万公顷，预计总产量可达265万吨。但是，国内棉花市场产不足需的局面仍将存在；加之棉花收购全面放开，全区棉花加工厂过多，加工能力严重过剩，新疆棉花市场无序竞争、秩序混乱、非法加工、争抢资源的情况极有可能发生，有关部门应该提前做好管理和协调工作。
