大豆与玉米套利存在较强的逻辑关系，主要体现在两方面。首先，大豆与玉米在作物种植上存在明显的耕地竞争关系。无论是在中国还是美国，大豆和玉米的生长期、适宜种植地域接近，农户根据种植效益（价格）调整其有限耕地上大豆、玉米的种植面积比例。例如，据CBOT市场多年走势可知，大豆与玉米比值一般在2.0-2.2区间变化，如果比值长期高于2.2，则将使新年度大豆种植意愿较高，进而增加种植面积与产量，最终使大豆价格相对玉米回落，比值回归。
其次，在饲料应用上大豆压榨生产出的豆粕与玉米存在不完全的替代关系。在我国，约70％的玉米消费是用作饲料，豆粕全部用作饲料。例如猪饲料配方中，玉米占50-60％，豆粕占10-20％，其它占20％，饲料企业会根据各类成分的市场价格高低调整其使用比例。应注意到，玉米是能量饲料，豆粕是蛋白饲料，两者不能完全相互替代。由上，大豆、玉米在农户种植作物选择、饲料成份上的替代关系共同构成大豆与玉米套利的理论基础。
同时，从中长期看，我们认为今后的大豆与玉米市场形势及变化趋势也有利该比值由低处回升。
从供应方面看，10月至明年5月的大豆主要供应源是中国和美国，而今年两国均是大豆减产、玉米增产，尤其是中国大豆减产较大、农户惜售较重，随着后期新作逐渐上市，相对而言利多大豆、利空玉米。其次，据大商所9月组织的东北考察，大豆种植效益在各类秋作中处于最低（表1），平均而言今年大豆种植成本约在400-450元/亩，净利润平均200-300元/亩，而玉米成本在500-600元/亩，净利润平均500元/亩，是大豆的两倍多。由此，明年我国农民选择播种玉米的积极性仍可能较高。从全球范围看，美国 、南美同样存在玉米种植效益高于大豆的情况，南美最新开始的播种年度已出现玉米种植面积扩大的明显趋势。这可能进一步加剧后期大豆与玉米供应形势的差异，推动比价回升。
从需求方面看，国产大豆为非转基本大豆，较大部分用作食用（如豆腐、豆粉等豆制品），而我国食用大豆需求呈不断增长之势，是进口转基因大豆无法取代的。另外，畜牧及饲料行业对豆粕与玉米的需求将长期稳定增加，但由于玉米价格居高不下，今年下半年起许多企业开始采用小麦作为能量饲料大量替代玉米。
从政策角度看，今年大豆收储政策继续实行可能性较大，预计在11月出台，考虑到种植成本的增加，收储价可能上调到4000-4100元/吨，并且农户心理价位普遍达到4200之上，这将为大豆现货提供坚实支撑。而玉米今年是否收储尚无定论（去年因价格高企而取消），若实施，国家也将顾虑到与市场争粮将引发价格抬升，预计收储价将定在略低于市价的水平，约1950-2100元/吨。按大豆与玉米收储价估计，两者的价比最低为1.905。
综上分析，我们认为大豆玉米套利在基本面与技术面两方面都较为一致，在宏观面潜在风险较大的情况下，该套利不失为一个良好的投资选择。在交易策略上，建议选择5月合约操作，以1：2买豆一抛玉米，比值达1.85-1.9进场，止损1.84，达1.95-2.1出，滚动操作。
最后，该套利存在的以下主要风险：尽管国内玉米丰收，但目前国储与市场的玉米库存均处于历史较低水平（大豆库存相对较高），政府大幅增加玉米进口补库可能引发市场炒作推升玉米价格；深加工行业对玉米的需求仍然保持旺盛，并愿意以较高价格收购，支撑玉米价格；宏观面的不确定性也可能造成价比出现巨大波动，带来不可预测的风险等。
