法国政府为暂停种植转基因玉米而使用了欧盟一项保护条款，此条款允许成员国以对健康和环境产生威胁为由，暂时禁止获欧盟允许种植和销售的某种转基因产品。
促使法国政府做出这项决定的最直接原因是，法国转基因产品临时最高委员会主席、参议员勒格朗9日提交的一份意见书。这份意见书“严重怀疑”MON810型转基因玉米的安全性，并声称“存在一些新的科学事实”，证明转基因玉米对“动植物存在不利影响”。
遭到禁止的MON810型转基因玉米由美国孟山都公司研发。这种玉米在自然生长过程中会产生一种名为Bt的毒素，后者能够杀死长期困扰农场的害虫玉米螟，从而使农户省下喷洒农药的成本开支。不过，这种玉米的安全性一直是科学家以及法国乃至欧洲民众争论的焦点。
对于此次提交的意见书，法国转基因临时最高委员会内部也存在不小分歧。委员会18名科学家中的14名于10日晚发表声明，质疑勒格朗有关“严重怀疑”和产生“不利影响”的说法。声明说：“这些措辞并没有出现在(最初的)意见书里面。我们一致同意使用的措辞是‘疑问’。”其中一名科学家说：“由于时间紧张，我们没能全面鉴定MON810型玉米，也没能够在发布意见书之前再认真审读一遍。”
而勒格朗则针锋相对地指出，意见书文本的每一行都是经过委员会全体成员认可的。
此外，这些持不同意见的科学家认为，此时启动欧盟保护条款时机并不成熟。科学家热拉尔·德沃谢尔说：“1998年以来出现的新证据促使我们更深入地进行研究，但它们并不足以让人质疑这种转基因玉米的安全性。”同时，法国科学信息联合会也收集了1000多位研究人员的签名，反对暂停种植转基因农作物。
然而，法国政府仍然采纳了被广泛质疑的意见书，做出了暂停种植转基因玉米的决定。
事实上，法国政府的这一举措并不令人感到费解，因为过去几年中，法国一直反对新的转基因产品进入欧盟市场。例如，在去年11月举行的欧盟成员国农业部长会议上，法国就与德国、奥地利、希腊、卢森堡和波兰等国一道主张欧盟暂停批准新的转基因产品进入欧盟市场。
法国的这一立场一方面源于国内民众对转基因食品的普遍质疑，另一方面也是出于经济利益的考虑：2005年，全球转基因作物种植面积接近9000万公顷，而法国仅有2.2万公顷，民众的不支持直接导致了法国在转基因作物种植和研究上不占任何优势，这使得这个欧洲农业大国对发展转基因作物持消极态度。
法国政府的决定宣布以后，反转基因阵营纷纷表示支持，而在法国西南部地区，很多谷物种植者对政府的决定感到愤怒。一些人正打算采取“非暴力不合作”的方式对抗禁令，从西班牙购买种子继续种植转基因农作物。
此外，按照规定，法国还要向欧盟委员会提交新发现的科学证据，然后由欧盟食品安全机构对这些证据进行为期数月乃至数年的审查，再提出具体意见。在此之前，法国将无法借助欧盟影响其他成员国对待转基因产品的态度。因此，可以预计，法国国内乃至欧盟国家围绕转基因产品的争论不会很快平息下去。
