由于此前中国已经履行了绝大部分降税义务，因此，2006年税率下降的幅度和税目数均明显减少，对关税总水平影响不大。2006年的关税总水平仍为9．9％。其中，农产品平均税率为15．2％，工业品平均税率为9．0％。
此外，明年我国将继续对小麦、玉米等7种农产品和磷酸二铵等3种化肥实行关税配额管理，取消豆油、棕榈油、菜籽油3种农产品的关税配额，对关税配额外进口一定数量的棉花继续实行滑准税；对冻鸡、啤酒、胶卷、摄像机等55种商品继续实行从量税、复合税，并根据进口平均价格的变化适当调整了部分从量税税率；对200多项进口商品实行暂定税率。
2006年大陆将继续对原产于台湾地区的菠萝、番荔枝、木瓜等15种新鲜水果实行进口零关税。在出口关税方面，从2006年1月1日起，中国将停止征收纺织品的出口关税，并对60多项出口商品实行暂定税率。此外，中国明年还将对部分税目进行调整，调整后税目总数将由2005年的7550个增加到7605个。
