几个月来，欧盟内部对是否批准在食品市场上公开销售ｂｔ－１１展开了激烈争论。法国、奥地利、葡萄牙等国坚决反对；西班牙、比利时、德国等国保持中立；而意大利、英国、荷兰等国坚决支持。鉴于此种情况，根据欧盟的新规定，欧盟委员会于１９日对这一问题作出最后裁决。尽管欧盟委员会在解释这一裁决时表示，批准销售的转基因玉米与以传统方式生产的玉米一样安全可靠，然而法国等许多反对转基因食品的国家仍对此表示强烈担心。
在转基因食品是否安全问题上，科学家与民众的态度对政府有重要影响，然而欧洲公众和科学界的看法就存在严重分歧。大部分专家认为，只要准确评估，转基因食品不仅不会危及人类，还可能因为其生长过程中不用杀虫剂而有利于人体健康。然而经历了多次食品安全危机的欧洲民众却不这么认为。自１９９６年英国发现疯牛病以来，欧盟区域的食品安全问题不断，在随后的“二恶英”污染、禽流感、口蹄疫等一连串事件的冲击后，欧洲人在食品安全问题上谨慎了许多。有调查显示，７０％的欧洲人不想吃转基因食品。
转基因作物正好是在欧洲人普遍担心食品安全的时期迅速发展起来的。它的迅速发展始终伴随着人们的质疑。１９９８年，英国学者发现，幼鼠食用转基因土豆会使内脏和免疫系统受损；１９９９年美国康乃尔大学副教授约翰·罗西表示，一种转基因玉米可产生杀死害虫的花粉，而身为益虫的一种美州大蝴蝶食用了这种花粉后有４４％死亡；２０００年，法国农业专家研究发现，转基因油菜可与野生萝卜自然杂交，这对周围环境可能会产生一定影响。尽管类似质疑均证据不足，但这足以破坏欧洲人对转基因食品的胃口。
民众的谨慎导致了欧洲一部分国家对转基因技术的重视与投资，与美国等国大不相同，并由此产生了与不少转基因作物大国不同的经济利害关系。截止２００１年，全世界转基因作物有５０００多万公顷，而欧洲种植的转基因作物只有１．２万公顷，其中法国仅有２０公顷。不同的经济利益又导致了不少欧洲国家对转基因食品存在排斥态度，并与赞成的国家产生争执。
据悉，鉴于成员国对转基因产品依然存在很大分歧，欧盟在近期内还不会解除对ｂｔ－１１的种植禁令。然而转基因产品可以带来很大利益，那些种植转基因作物的欧盟国家今后还会不断向欧盟委员会提出新的解禁转基因食品要求，并势必与其他成员国利益以及民众情绪产生冲突。由此看来，欧洲内部的转基因食品争吵还将继续下去。
