自上世纪八十年代末起，香港的渔业资源不断减少。研究显示，香港的鱼获量近十年内下降百分之五十，鱼苗数量更大幅减少九成。新建议的渔业管理方案包括订立捕鱼牌照制度，订立渔业保护区，及实施全港性「休渔期」。政府建议，在香港水域使用渔船捕鱼必须持有效捕鱼牌照。无牌捕鱼最高罚款达二万五千元及入狱半年。划定吐露港和牛尾海为渔业保护区，面积约占一万三千七百公顷，是全港水域的百分之八点三，并在区内的人工鱼礁投放地点设立禁捕区。每年的六至七月在香港水域实施休渔期，禁止一些非选择性及对生态环境有较大影响的捕鱼活动，如拖网及围网作业。
香港目前约有四千六百艘渔船，其中千多艘不在香港水域作业，只有三千五百艘左右须领取鱼牌。
