目前智利生产的鱼粉大部分在本国消耗，主要供三文鱼养殖业作为饲料。用以出口的仅占小部分，约50万吨，主要的出口市场集中在亚洲国家。
欧盟国家曾认为鱼粉作为牲畜饲料有可能导致疯牛病，由此自2001年以来中断了从智利和秘鲁两国进口鱼粉。目前上述两个世界上最主要的鱼粉生产国家正在积极采取措施，例如将派遣一联合委员会赴主要的欧盟国家开展多方面的工作。智利全国渔业协会表示，如果两国的努力富有成效，将有望于明年一月开始恢复向欧盟国家出口鱼粉。此外，该协会还认为，目前没有科学根据能够说明鱼粉是导致疯牛病的原因。
