受H7N9禽流感影响，禽肉类价格下跌，大量活禽滞销，中国家禽业受重创。中国畜牧业协会对财新记者表示，经初步测算，截至4月21日，中国家禽业约已损失230多亿元。
此前，各地针对检出H7N9阳性样品的市场，均开展了扑杀工作。根据4月7日农业部下发的《动物H7N9禽流感应急处置指南（试行）》，经农业部确认为H7亚型禽流感病毒感染阳性的，对感染群的所有动物进行扑杀；感染群在交易市场或屠宰场的，应立即关闭该交易市场或屠宰市场。
截至4月24日，农业部已从各地采集到共43份H7N9禽流感阳性样品，这些样品均来自各地的农贸市场或活禽市场。
各地对因防治H7N9禽流感被扑杀家禽而受损的商户，陆续出台了相应的赔偿政策。以上海为例，上海市政府在4月11日下发了《市政府关于对在本市防控H7N9禽流感中受到影响的家禽养殖场（户）给予财政补贴的通知》（下称《通知》），《通知》对于种禽场、孵化场和家禽养殖场（户）的补贴均有明细规定。虽然上海此次补偿比例并不低，但也未能完全按照市价补偿。
即便如此，此类商户仍能得到一定补助；而养殖环节由于产品滞销、价格下跌损失惨重，却少有风险保障。
中国畜牧业协会禽业分会副秘书长宫桂芬对财新记者说，禽产品价格下降、销路不畅，导致大量活禽积压，不少鸡苗刚孵出来就被销毁。国家发改委价格监测中心数据显示，4月中旬，全国鸡肉平均价格为8.86元/斤，较4月上旬下降7%，较三月环比下降4.9%。
H7N9禽流感发生以来，上海、南京、北京等各地相继停止活禽交易，上海、南京、苏州、杭州、郑州等多地禁止外来活禽进入。据宫桂芬介绍，疫情发生后，南方航空、海南航空等航空公司的部分线路和一些陆路运输公司不再承揽活禽运输，使活禽销售雪上加霜。
2005年，为应对H5N1禽流感对家禽业的冲击，国务院下发《关于扶持家禽业发展的若干意见》，出台对相关企业和农户免税减税、补贴种禽、财政贴息贷款、延长还款期限等临时优惠，但大部分措施仅执行到2006年底，并未形成长效常规的保障机制。
此次针对受H7N9禽流感影响而遭受损失的商户，在国家层面尚未有相关补助意见出台，但地方已有尝试。上海市的《通知》提出，对上海市范围内的肉鸡和淘汰蛋鸡实行定点保护价收购；其后，上海市农委组织区县农委与家禽定点屠宰点签订《本市家禽定点保护价收购协议书》，意在缓解郊区地产家禽销售困难，维护家禽养殖场（户）经营者利益。根据上海市政府消息，仅4月12日当日，全市有9个定点企业按照市政府制定的保护价全面启动收购，收购地产家禽64850只。
此外，国家亦试图通过养殖业保险弥补损失。4月15日，保监会发布《关于做好家禽保险禽流感责任理赔工作的通知》，要求各保监局、保险公司采取切实措施确保农业保险理赔工作的开展。然而据人民网报道，截至目前，保监会尚未接到一起保险公司对H7N9禽流感理赔的报案。养殖业保险目前国内并未广泛推广，仅上海等少部分地区对养殖业保险有政策性补贴，总体保险覆盖范围很小，绝大多数家禽养殖户完全自担风险。
北京工商大学经济学院保险学系主任、教授王绪瑾此前在接受财新记者的采访时曾表示，目前鸡鸭发生禽流感几乎成为必然概念，其面积和扩展程度如此，已属不可保风险，面对低迷的资本市场和必须考量的利润，眼下几乎不可能有商业保险涉足其中。
宫桂芬也认为，家禽养殖业疾病风险高，盈利空间小，商业保险公司进入的动力不大，需要政府补贴一部分保费，撬动保险公司开发此类保险产品。“中国家禽业有企业和农户4400多万户，涉及1.32亿从业者，H7N9禽流感对整个家禽业损伤严重，波及面广，希望政府能早日出台相关扶持措施。”
