所谓鱼病的生态预防就是按照养殖鱼类的生态习性和鱼池水体环境的生态特点，根据鱼病发生和发展的规律来防止鱼病的发生，抑制鱼病的发展，直到消除鱼病的方法。
一、改善水体生态环境，消灭和抑制病原
改善水体生态环境是预防鱼病的基本前提，包括改善底质和水质两个方面。首先清除淤泥，因为它是水体中的主要耗氧源，又是病原体的滋生和藏身处，大量的有机物质在缺氧的条件下产生氨或胺及硫化氢等有害物质，直接或间接地引起鱼类发病或死亡。高产鱼池每年都必须清除淤泥并消毒，同时清理改造进排水设备，做到进排分开，防止鱼病的交叉传染。科学调节水质，如开增氧机，定期注、排水等以增加水中溶氧，保护水质清新，防止鱼病发生。
二、高速养殖结构及周期，提高鱼体内在抗病力
我国池塘综合养鱼的主要老年虽多品种、多规格混养、轮养、发病对象主要是草鱼、青鱼等吃食鱼，发病殖品种结构，即利用杂食性鱼（如罗非鱼、鲫鱼等）整吃食鱼、杂食鱼、肥水鱼的品种和比例。二是调整生产周期，使草鱼、杂食鱼、肥水皇的品种和比例。二是调整生产周期，使草鱼、青鱼快速生长，增强抗病力以避开发病高峰期。如广东改3—4月放种以上年10月放种，改放春片为放秋片，改放小规格鱼种为放大规格鱼种；长江流域改单季育种为双季育种等。这些方法都有效地阻止了鱼病发生，提高了吃食鱼的成活率。
三、改进饲养管理措施，提高鱼体抗病能力
池塘鱼类发病有相当一部分是由于饲养管理不当引起的，因此应适应鱼类的生态要求，改进饲养管理措施。一是改进投饲技术，在按常规“四定”投饵的同时，应根据鱼类营养要求和摄食规律，积极推广配合饲料，青、精、粗相结合；在投饲方式上实行“两头精、中间青”，特别注意5—7月两个变温期的发病高峰期，应以精为主，辅以青料，并节制投喂，以防肠炎病的发生和蔓延。二是改进施肥技术，在按常规做到“四看”、适时、少施、勤施的同时，根据水温和水质变化规律，结合鱼类对水质的要求，以有机肥为基肥，春秋两季追施有机肥和无机肥，夏季少施分散肥，并以无机肥为主，保持水质“肥、活、嫩、爽”。坚持巡塘，及时清除残饵、杂物及死鱼等，确保池塘及周围环境的卫生。
