为切实保障南水北调工程水质达标，保护我市渔业生态环境，实现渔业的可持续发展，济宁市渔业局积极探索，加快推进渔业净水、以渔养水的生态渔业发展。
一是合理规划。制定了南四湖渔业功能区划，限定了养殖总量，结合南四湖渔业养殖污染防控行动，积极实施生态渔业改造工程，在规范中改造，通过改造转型升级，力争把南四湖湖区规划的5万亩网围养殖区打造成高标准生态渔业示范点。
二是推广生态养殖模式。因地制宜，推广发展“以鱼养水”、“循环渔业”等生态养殖模式，池塘养殖向节水、循环健康养殖发展，工厂化养殖向集约化循环水发展，湖泊、水库等大水面向资源增殖净水型渔业发展，分区域规划好25万亩规模化生态池塘养殖区，发展内循环渔业，示范开展沿湖生态池塘升级改造。
三是加强渔业监测监管力度。加强水产品质量抽检和养殖水域环境监测力度，实施全市水产品质量和主要养殖水域监测日报制度，定期向社会公布。同时，联合有关部门加强水产投入品的安全监管，加强渔业病害的监测，减少养殖病害的发生和抗生素、饲料等污染水体。
