这项全面的研究主要集中在理解传统的饲料抗生素对美国农场的影响，研究发现，猪饲料中的抗生素增加了猪的消化道微生物中对抗生素有抗药性的基因数量。
几十年来，许多猪、鸡和其它农场动物的饲养者使用抗生素不仅是为了保护他们的牲畜远离疾病，而且还为了提高家畜的增长率和提高饲料转化效率，以及采取使动物将饲料转换成增重的措施。
科学家并不确切地知道抗生素如何提高生长率和饲料转化效率，但他们担心，在农场使用这些药物可能导致微生物菌株的发展，这些菌株对常规抗生素有抵抗力，对人类和动物有潜在的危害。密歇根州立大学微生物学和分子遗传学和作物和土壤科学的教授詹姆斯（James Tiedje）说：“病原体的抗生素耐药性的增长对全世界是一个巨大的挑战，研究是为了更好地了解什么原因导致疾病的传播以及什么样的干预措施能帮助控制传播。”
其他发现包括：
1.在用抗生素治疗后，猪肠道的微生物群落的抗生素抗性基因的多样性和丰富性增加。这需要较长期的研究。
2.疗过的猪中意外发现一些基因，通常与没有在研究中使用的抗生素有联系。
3.养抗生素的猪身上，与生长有关的抗菌基因和微生物能源使用大量增加，这可能揭示抗生素如何提高家畜生长速度和饲料转化效率。
4.抗生素的猪的大肠杆菌数量增加。需要进一步研究，以澄清此项观察。
美国农业部的研究人员托列伊·洛夫特（Torey Looft）说：“据我们所知，这是科学家首次研究农场动物饲料中使用抗生素的影响，使用全面的方法来检测动物胃肠道的微生物群落的变化。”
