用大黄治疗草鱼疾病，不同的鱼病可用不同的配方。例如，治疗病毒性出血病，每百公斤鱼可用大黄250克；黄檗150克，黄岑（俗称三黄）100克，混合研碎后，加食盐1公斤，用水和匀，拌入面粉，将其粘在嫩草上晾干，再投入鱼池中喂鱼，连喂5-7天。治疗细菌性烂腮病，每亩水面可用大黄500克，放入10-公斤氨水或将碳酸氢铵对成的水中，浸泡12小时，然后取药液全池泼洒，使药液在鱼池水中的浓度达到3×10-6，连用几天，即能治愈。
大黄是含黄连素的中药，可用于防治草鱼病毒性出血病、细菌性烂腮病、肠炎和赤皮病等。在草鱼发病季节到来之前，每100公斤鱼用大黄100克，煎熬成汁，拌入饲料中投喂，连喂3天，即可起到预防作用。
