金头闭壳龟自然分布于安徽，1988年才被发现，因此，未能列入国家保护动物，已列入安徽省一级保护动物，濒危野生动植物物种国际贸易公约CTTES已经将金头闭壳龟列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录二加以保护。目前仅知分布于安徽省的少数地区，在青弋江上游的黟县和泾县两地分布。由于它分布区域狭窄，数量稀少，濒临灭绝，2005年以来，未有野生金头闭壳龟发现。近年来，原产地黟县的清溪河、泾县的漕溪河、汀溪河、孤峰河自然生态逐步恢复，泾县的汀溪河上游的爱民村到宁国的板桥生态环境较好，沿溪流的村民居住人数也少，是相对较适宜金头闭壳龟生存的区域。
由于金头闭壳龟种群数量极少，繁殖难度较大，现有总量不超过300只，年产苗40余只。野生的金头闭壳龟已难觅踪迹，人工养殖的现存量主要分布在安徽、上海、江苏、浙江和北京等地。安徽省现在保有金头闭壳龟8只，其中省长江水生动物保护研究中心7只，安徽师范大学1只。民间收藏并养殖，较早的首推江苏无锡许先生，上海唐先生和湖北张先生都是从无锡引种的。上海现有5家从事金头闭壳龟养殖，其中4家已经繁殖成功，2009年唐先生年产苗20只，徐先生年产苗10只，陆先生年产苗6只，金先生年产苗2只；杭州胡先生年产苗2只；北京王先生年产苗2只。有希望繁殖成功的有上海杨先生，南京朱先生和湖北张先生等。根据目前的基数和繁殖速度，10年后该种群难以突破1000只。今年金头闭壳龟亲龟市场价格每只25万元，苗价4万元。问题是雄性亲龟奇缺，受精率普遍不高。
金头闭壳龟种群增殖希望在哪里？笔者认为希望在民间。尽管有不少学者进行研究，举办讲座，政府联合科研单位和高等院校进行野外调查等一系列保护工作。如2006年9月15日，华师大举办的讲座上，Markus Auer博士主讲“金头闭壳龟的保护”；安徽省渔政渔港监督管理局组织省长江水生动物保护研究中心、安徽农业大学动物科技学院联合进行科学调查。但实实在在的还是民间收藏爱好者的高投入、高风险地进入该领域，百折不饶，精心培育，不断扩大种群。
