得益于科技工作者持续不断地开展云南土著和特有鱼类人工繁育、迁地保护、种群恢复、生物多样性保护利用等方面的科技攻关，以金线鲃、鱼康鱼良鱼、云南裂腹鱼、短须裂腹鱼等为代表的一批云南珍稀濒危土著鱼类人工繁育获得成功，种群数量不断增加，有的还实现了商品化养殖。此举不但为物种保育、生态保护作出了重要贡献，也为发展规模化云南特色水产养殖，促农增收打下了坚实基础。
云南鱼类种数约占全国淡水鱼总种数的近一半，本地特有的“土著鱼”种类数量居全国之首。然而，由于环境污染，盲目引种，水质恶化，过度捕捞等原因，以云南四大名鱼——洱海弓鱼、滇池金线鲃、抚仙湖鱼康鱼良鱼和星云湖大头鲤为代表的一批云南土著鱼类日渐减少，濒临灭绝。
针对高原珍贵淡水鱼种质资源的保护利用，该省科技工作者积极开展土著鱼类提纯复壮、保育和保种等科学研究，并不断取得新突破。中科院昆明动物研究所成功建立起集迁地保护、种群恢复、人工繁育和可持续利用研究为一体的云南珍稀特有鱼类保育研究中心以及3个生态湿地恢复实验区。从种群亲体数量略大的鱼康鱼良鱼入手，历时数载突破人工繁育瓶颈，使这一珍贵鱼种得以保护，极大地促进了鱼康鱼良鱼的恢复和增殖，目前抚仙湖鱼康鱼良鱼数量在持续增加。此后，该所系统进化与生物地理学鱼类学科组在副所长杨君兴研究员带领下，以全球环境基金资助的中国云南淡水水生生物多样性恢复项目及云南省发展和改革委立项的滇中高原主要湖泊土著特有鱼类迁地保护和人工驯养繁殖项目为平台，通过5年科技攻关，攻克了滇池金线鲃人工授精、孵化、人工饵料培育和鱼病防治等多项技术难关，在世界上首次人工繁育出滇池特有珍稀名贵鱼类金线鲃。今年又新繁育出10万余尾鱼苗。经过4年多努力，该所星云湖大头鲤的提纯复壮与人工繁育也取得了较大进展，部分大头鲤纯度高达95%，已实现了人工繁育。与此同时，在省科技厅等部门支持下，云南省渔业科学研究院人工繁育珍稀土著鱼类云南裂腹鱼、短须裂腹鱼、小裂腹鱼获得成功，人工驯化出云南特有鱼类巨鱼丕，正在进行叉尾斗鱼、线足鲈等观赏土著鱼的人工繁育研究。在去年成功繁育丝尾鳠的基础上，该院已在西双版纳、文山、红河推广丝尾鳠池塘养殖1000亩。此外，经过相关单位努力，石屏乌鳢、陆良鲶鱼等一批土著鱼已重回百姓餐桌，金沙江鲈鲤、保山四须鲃、大刺鳅等云南特有土著鱼的人工驯养研究进展顺利。
