据该报告称，几个主要的金枪鱼鱼种中，目前该水域只有黄鳍金枪鱼可能出现了过度捕捞。尽管大多数分析均显示黄鳍金枪鱼非常接近于过度捕捞状态，但结果仍存在一些不确定性。
IOTC科学委员会建议，黄鳍金枪鱼年渔获量不应超过33万吨，即1998-2002年代平均水平，目的是不重复2003-2006年的渔获量水平，否则该资源将可能会出现过度捕捞。
2008年前9个月黄鳍金枪鱼围网产量稍高于2007年同期报告的水平，这也表明渔获量水平及资源量可能返回到2003年以前的水平。
这份报告强调，黄鳍金枪鱼将来的渔获量所存在的不确定性仍依赖于近期状况的变化，一些渔船离开渔业，而临近索马里水域的渔场也因安全因素等致使渔获量在短期来看低于2003年以前的水平。对于长鳍金枪鱼而言，科学委员会并不认为该资源已过度捕捞，同时也未处于过度捕捞中。据该报告称，鉴于目前的资源状况及稳定的努力量，今后2-3年内长鳍金枪鱼资源状况不可能发生较大的变化。另外，如果长鳍金枪鱼价格较其它金枪鱼鱼种低，委员会将不会采取直接的行动。
尽管目前的水平仍未处于警告状态，但委员会预计大眼金枪鱼的开发将返回到2003年以前的水平。如果出现这种情况，目前的展望将更为悲观。
科学委员会注意到，以鲣鱼为目标鱼种的围网FAD渔业对大眼金枪鱼幼鱼的捕捞。该报告表示，减低印度洋大眼金枪鱼捕捞的某些措施同时也降低了鲣鱼的产量，而后者也是唯一一种未纳入到资源养护的鱼种。
