目前，可以基本诊断病死家禽为低温导致的呼吸道病综合感染，其中部分合并感染鸡新城疫。
江苏省农林厅厅长吴沛良在发布会上表示，根据国家禽流感参考实验室诊断结果，农业部已确认在江苏东台市、海安县个别农户饲养的蛋鸡中监测到的禽流感病毒为禽流感H5N1的变异株，与2006年山西出现的变异株高度同源，确与原南方流行株不同，该病毒对哺乳动物感染率极低，到目前为止没有发现该病毒感染人的病例。2006年山西疫情发生后，国家禽流感参考实验室立即研制出疫苗，应用效果很好。目前江苏正在使用该疫苗对全省家禽进行免疫。
江苏在例行监测中监测到阳性疑似变异毒株后，各级政府及相关部门高度重视，迅速采取措施积极应对。一是对监测阳性鸡群及周边地区家禽进行扑杀，并进行无害化处理。二是实行隔离监控措施。三是全面部署使用针对变异病毒的疫苗，进行全面紧急免疫。四是开展消毒灭源工作，对被扑杀家禽的养殖场(户)及周边地区环境进行彻底消毒，防止病毒传播扩散。
江苏省动物疫病预防控制中心的专家表示，此次在东台和海安监测到的禽流感变异毒株可能是候鸟带来的。目前海安县、东台市以及周边地区的所有家禽已全部注射变异病毒疫苗，全省家禽在20日前实现全面免疫。这种疫苗注射8-10天后即可产生较好的免疫抗体保护，将有效防变异病毒的扩散。
吴沛良表示，事情发生后，海安县和东台市立即采取隔离监控措施，在道口设立了由公安、兽医与工商等部门联合执勤的检查消毒站卡，开展严格的隔离监控和消毒措施，对运输家禽及其产品的车辆劝返、对过往的其他车辆进行消毒。“当地采取的隔离监控措施是严格的，进入正规市场销售的家禽与产品也是经过检疫的，消费者可以放心食用。”吴沛良说。
