问题鸡蛋事件影响首先体现在鸡蛋价格上，据了解，事件发生后，国内鸡蛋批发价急剧下跌，多数养殖户徘徊在盈亏边缘。目前，国内鸡蛋批发价大幅下跌到2.6 3.2元/斤，比上周下滑0.2 0.4元/斤。
分析人士认为，除鸡蛋价格下滑之外，该事件的深远影响是将会波及整个产业链，国内饲料行业受冲击最大。
尽管问题鸡蛋的三聚氰胺源头目前尚未确定，但国金证券肉禽鱼产品加工行业分析师谢刚表示，如果源头最终被确认发生在养殖饲料环节的话，那么该事件会使利润微薄、竞争激烈的饲料行业雪上加霜。“在行业经历十年低迷、盈利不断滑坡的背景下，不排除一些小规模的饲料企业（饲料行业门槛较低）采取不法行为牟取利益。”谢刚指出。
对于此次事件的影响，国内某大型饲料生产企业一高管说：“如果不及时处罚个别违规者，整个行业因此会受到巨大冲击。饲料是食品产业的基础性行业，国家会迅速出台相关解决方案。”从管理层的态度来看，对饲料企业的抽查和三聚氰胺含量标准的制定将势在必行，不管最终调查结果如何，都有利于饲料行业新一轮的洗牌。
“笑到最后的企业往往是综合竞争力强的优势企业，但鸡蛋安全事件对饲料行业造成的短期负面影响仍不可忽视，尤其是肉鸡、蛋鸡等养殖积极性下降带来禽饲料销量下滑与价格下跌几乎是不可回避的。”
但分析师对问题鸡蛋负面影响的态度比较乐观，认为由于此次事件主要集中在辽晋鄂三省四企业，不是大范围超标的行业性事件，据此判断实际的社会影响有限，低于上次问题牛奶的振荡和冲击。
“从牛奶，到饼干，再到鸡蛋，三聚氰胺已经威胁到多数食品行业的安全，因此三聚氰胺鸡蛋事件对于消费者心态的影响远远大于安全问题，本次鸡蛋中发现三聚氰胺超标可视为以上食品安全问题的延续或升级，但对相关行业及重点公司的影响程度远小于乳业。”谢刚表示。
