蛋白质分为动物性蛋白和植物性蛋白两大类。现在，科学家已经通过酶解细化，把豆粕转化为寡肽蛋白，取得替代动物蛋白，减少对鱼粉依赖的良好效果。目前，我国水产动物蛋白饲料主要依赖于鱼粉，实质上还没有摆脱“以鱼养鱼”的状态。而美国等发达国家已通过合成蛋白质替代鱼粉，不但减少了鱼粉消耗，还腾出相当数量用于出口。
据有关文献，虹鳟鱼饲料中用27%的肉骨粉代替约50%鱼粉，对其增重和饲料效率无显著影响，添加氨基酸后的肉骨粉还可以作为虹鳟饲料的惟一蛋白源。饲料中用20%的肉骨粉代替鱼粉对大马哈鱼生长无不利影响；含47%的低灰分肉骨粉和12%的鱼粉投喂尖吻鲈与投喂含鱼粉47%饲料的鱼相比无显著差异。肉骨粉蛋白质含量为45%-50%，铁、钙、磷等矿
物质含量很高，用肉骨粉做饲料的动物性蛋白源饲养对虾，不仅提高了饲料的消化吸收率，有效地促进了虾生长发育，而且明显降低了养虾成本。有人用禽毛粉和禽油代替鱼粉和脂类养殖鲑鱼和鳗鲡，都取得了成功。
大量的研究资料表明，用低廉而丰富的动植物蛋白源及单细胞蛋白源部分或完全代替鱼粉是可行的。所谓水产养殖业对鱼粉的“刚性需求”并非科学论断。在鱼粉价格飙升的今天，只有开发鱼粉替代之路，才能避免受制于人。
