一、 体表： 将病鱼置于盘中依次从头部、嘴、眼、鳃盖、鳞片、鳍等顺序仔细观察。
（一） 检查有无大型病原体。如水霉、嗜子宫线虫、锚头蚤、鱼虱、钩介幼虫等。
（二） 根据症状辨别原因。如车轮虫、鱼波豆虫、斜管虫、三代虫等寄生，一般会鱼体分泌大量黏液，有时微带污泥，或是头、嘴及鳍条末端腐烂，但鳍条基部一般无充血现象。 双穴吸虫病，则表现出眼睛混浊，有白内障。细菌性赤皮病，则鳞片脱落、皮肤充血。疖疮病则在并变部位发炎、脓肿。白皮病的病变部位发白，黏液减少，用手摸时有粗糙的感觉。腐皮病的病变部位产生侵蚀性的腐烂等症状。发现病鱼肌肉、鳃盖和鳍基充血发红，可初步诊断为病毒性出血病或爆发性鱼病，病鱼尾巴极度上翘、颅脑发黄，在水中狂游打圈，则为疯狂病。但有些病状，包括体表、鳃、内脏等的症状，在几种不同的鱼病中基本是一样的，如鳍基充血和蛀鳍的赤皮病、烂鳃病、肠炎病及一些其他细菌性鱼病；又如在大俩昂车轮虫、鱼波豆虫、斜管虫、小瓜虫、三代虫等寄生时，都会在体表、鳃部有较多的黏液，所以应把观察到的病状，联系起来家以分析。
二、 鳃 鳃部检查，重点是鳃丝。
（一） 首先要注意鳃丝是否张开。
（二）将鳃盖剪去，观察鳃丝的颜色是否正常，粘液是否正常，粘液是否较多，鳃丝末端是否有肿大发白和腐烂现象。如：患细菌性烂鳃病，则鳃丝末端腐烂，粘液较多。鳃霉病则鳃片的颜色较正常鱼的鳃片白，略带血红色小点，如患鱼波豆虫病‘鳃隐鞭虫病‘车轮虫病’斜管虫病‘指环虫病等寄生虫性疾病，则鳃丝上有较多粘液。如患中华蚤病’指环虫以及粘孢子虫等寄生虫性疾病，则常表现鳃丝肿大，鳃盖张开等症状。 又如：亚硝酸中毒，鳃丝颜色变为紫红色等。
三、内脏 将一边腹壁剪去，从肛门部位向左上方沿侧线剪去鳃盖后缘，向下剪至胸鳍基部，除去整片侧肌。
（一） 观察是否有腹水和肉眼可见的寄生虫。
（二） 仔细观察各内脏的外表，看是否正常。 肝胰脏正常颜色为粉红色，外表光滑。 肠正常时，因其中有食物粪便存在，呈暗褐色，边缘粉红色，鳔白色。 （三） 将内脏取出，分离，观察其内部症状。
1.剪断靠近咽和肛门部位的肠，取出内脏。
2.假案昂昂内脏逐个分离，观察质地，内部的症状，颜色。
3.分离肠道，将肠道分为前，中，后三段，轻轻将肠道中的食物，粪便去掉，然后观察。
（1） 观察是否充血或肉眼可见的寄生虫。如：肠炎病，会表现肠壁充血，发炎，溃疡。吸虫，涤虫，线虫等肉眼容易看得见。
（2） 观察肠壁是否有小寄生虫及肠壁的质地等。如：艾美虫病和粘孢子虫病在肠壁上一般有成片或稀散的白点。饲料营养缺乏等原因可产生肠壁变薄，质地脆的症状。
4.其他内脏器官，如在外表上未发现症状，可不再检查。
