建造鱼沟鱼窝。鱼沟鱼窝是鱼的活动、栖息场所，面积要求占藕田总面积的10%以上，最好达到15%，鱼沟深1米，鱼窝宽2米，深1．5米以上，沟与窝要相通。有条件的可利用草泥塘和田头进水渠道，加工成永久性沟窝。改进放养结构。藕田在生产后期，水面大部分被荷叶覆盖，溶氧量一般较池塘低，浮游生物也较少，而底栖动物、水生杂草、昆虫则较多。藕田中放养的品种应以耐低氧、食性广的鱼类为主，如鲤、鲫、鳊、鲂、青鱼、罗非鱼、鲶鱼等。还可放养少量的鲢、鳙鱼。要严格控制草鱼投放的数量、规格和时间，以免影响莲藕生长。
合理施肥。藕田施肥主要以尿素、碳酸氢铵为主，在荷叶长出水面前进行，每亩施25－50公斤。为防止施肥对鱼类造成影响，可采取半边先施、半边后施的方法进行。
多种养殖方式。如“藕萍鱼式”、“藕鱼轮作”、“藕鱼兼作”等方式。“藕萍鱼式”，就是在浅水中种藕，深水中养鱼，水面培育鱼的优良饲料——浮萍。藕田为鱼提供了丰富的生物饵料和良好的栖息场所，鱼粪又是藕田的好肥料，起了良好的循环作用。
加强管理。要经常检查拦鱼设备，防止逃鱼。做好清洁卫生工作，及时捞除剩渣残饵。定期注入新水，保持沟窝有一定水位。施肥用药要兼顾藕和鱼。
此外，要定期泼洒漂白粉液，定期投喂大蒜、韭菜、痢特灵等药饵。
