1、从死鱼季节和品种上区分。鱼病的发生一般是由春天开始，随着气温和水温的升高，细菌等病原体不断繁殖，到夏季鱼病最为严重，而且各种鱼病都有一定的品种选择性。化学物急性中毒则不同，无季节性差异和明显的品种选择性，仅与有毒化学物排入养鱼水体的时间有关。
2、从死鱼的前兆区分。鱼的发病和死亡有急性和慢性两种，其中急性鱼病发病很快，前兆明显，在死亡之前鱼的行为与正常鱼的行为没有明显的区别，看起来很正常但会突然大量死亡。这与化学性中毒鱼的冲撞、翻滚、跳跃表现是不同的，慢性鱼病的死鱼前兆比较明显，病鱼一般空胃、活动迟缓、离群独游、喜在暗处活动，虽然有些寄生虫病会使鱼跳跃、冲撞，但不会使鱼在短时间内大批死亡，这一点与化学性急性中毒突发性死鱼是完全不同的。
3、从死鱼的鱼体特征区分。生病死亡的鱼，体表和鳃部一般不存在附着物，有些病会使鱼鳃部腐烂，且有一些臭味，同时由于细菌、病毒及病原体通过水体、饲料、苗种等环节的传染，使得鱼病常有流行发生的趋势，即同一类型的鱼病可能在相当范围内发生。这与化学物中毒死鱼也是不相同的，化学物中毒死鱼是在有限的范围内孤立发生的，死鱼体表尤其是鳃部常附着一些污染物，并且带有那些物质特有的气味。重金属中毒时，鱼的鳃部受损害比较明显，甚至鳃叶部分脱落，鳃部分泌大量粘液形成絮状堆积物；磷中毒则鱼的眼球突出，鳞片竖立；氰化物中毒则鳃盖鲜红；余氯中毒则其体表、鳃丝发白；碱中毒则鱼体表存在大量的粘液等。
4、从死鱼的水体环境区分。因鱼病死鱼时，一般来讲水中浮游生物、浮游植物、水生植物和龟、蛇、螺等水生动物不会受到明显损害，数量不会明显减少，而化学物急性中毒死鱼时，水中其它生物也会发生中毒死亡，浮游生物的数量和品种会大量减少甚至消失，水中会有大量死亡藻细胞。
5、利用鱼病分析法区分。细菌性和寄生虫性鱼病，可以通过目检或镜检，在鱼的体表、鳃部、内脏、血液中检出病原体，而在化学物中毒死鱼的鱼体上是不可能观察到的。鱼类死亡的原因是多种多样的，应综合考虑各方面的因素，死因一旦确定，就须采取相应的措施。因鱼病造成的死鱼，须立即采取防治措施，以防鱼病进一步蔓延，造成更大的损失；属于化学物中毒引起的死鱼，就要及时向事故发生地渔业行政主管部门申请调解处理，也可直接向人民法院起诉。
