随着工业污染源的治理以及生活小区的截污纳管，农村养殖业带来的污染已成为影响河道水质的一大因素。从2002年开始，《杭州市畜禽养殖业污染综合整治工作方案》应运而生，以生猪及奶牛为主的三年禁养、限养活动启动。
宣传是起步，断猪之“粮”是关键。在杭州这个旅游城市里，有着相当发达的餐饮业，每天也产生了大量的泔水，一些村民便以此养猪。禁养初期，杭州市有关部门和乡镇组织人员上路检查，禁止泔水下乡，将泔水安排到天子岭垃圾场，进行无污染处理。接着组建了处理油脂的杭州绿园油脂有限公司，年吞吐泔水油量达到5000吨。后来，又出台了《杭州市餐厨垃圾处置管理暂行办法》，以地方法规的形式，完善泔水油的收集、运输、处理事宜。
断猪之“粮”还要拆猪之“房”。早些年，市郊一些农户在没有正式审批的情况下，沿河、沿溪搭建了许多猪棚。禁养当年，数万平方米违章猪棚被拆除，后来又关闭养猪场20个，养牛场35个。同时，指导、帮助养殖户向服装加工、花木种植等产业发展。对于规模较大的养猪场、养牛场，则鼓励其搬迁，并提供各种方便。为此，三年来杭州市共发放禁养补助资金5000余万元，其中发放市级禁养补助资金2800余万元。
在非禁养区，杭州市也大力开展生态养殖工作。如猪粪-蚯蚓-甲鱼；猪粪尿-有机肥-沼气-果园等生态养殖模式。还有猪尿-厌氧-种植等各种形式的综合利用工程。实现了变废为宝，畜牧业的健康发展，开辟了农业循环经济的新路子。对于新、改、扩建规模化养殖项目，农业、环保等部门认真贯彻有关规定，在项目立项、选址、环境影响评价等方面严格把关，防止新污染源的产生。
目前杭州市正在加大畜禽养殖业污染长效管理、防止反弹上下功夫。《杭州市畜禽养殖业污染管理办法》已列入2006年立法计划。过不了多久，这一办法就将出台、实施。
