巴比妥钠和苯巴比妥钠也可配成药水运输活鱼。将待运活鱼放入含有巴比妥钠或苯巴妥钠浓度为7－13ppm的药水中，不久鱼就会呈昏迷状态，腹部向上，呼吸减慢，不游动。水温在10℃时可使活鱼麻醉10多个小时。如果在运输途中保持适当的充氧量(以氧气钢瓶充氧)，可入连续运输50小时以上。将鱼运抵目的地后，将昏迷的鱼置于清水中5－10分钟就能缓解苏醒。
若是运输亲鱼，鱼下塘后一周内不必施肥、投饵，以保证亲鱼完全恢复。待6－7天后，方可逐渐投些精饲料(花生饼、豆饼)喂养。
巴比妥钠、苯巴比妥钠和戊巴比妥钠用于活鱼运输时，均可采用肌肉注射法。注射剂量为每千克鱼体用药0.1毫克。鱼经麻醉后会仰浮于水面，呼吸缓慢但有规律。如在运输途中发现鱼有跳跃冲撞，表示药量不足，应再予以注射适当药剂达到麻醉为止。如发现鱼的呼吸极度衰竭，说明麻醉过度，应及时注射可拉明(尼克刹米)或苯甲酸钠咖啡因，剂量为每尾鱼注射25%的注液毫升。巴比安钠和戊巴比妥钠的有效时间可维持8－10小时，苯巴比妥钠的药效时间可维持20小时左右。
