但是，随着内海湾网箱数量的猛增，海域污染引起的大黄鱼大面积死亡，已经使大黄鱼养殖成了高风险、低利润的行业。最近，记者走访被称为闽东“大黄鱼之父”——大黄鱼人工养殖的首创者刘家富时，刘家富对此十分焦虑：“出现这种情况，是因为闽东海域大黄鱼养殖大都集中在港口5－10米深的内湾，适合养殖的区域其养殖网箱已经过度饱和，无序、无度的养殖密度，影响了沿海的水体环境，如果再不调整养殖思路，对大黄鱼进行标准化养殖，向10－20米的开阔近海要空间，大黄鱼发展必将陷入养的越多、活的越少的怪圈，后果将不堪设想。”
三都澳港万顷鱼排，宛如“海上城市”，是诗人讴歌的情景。在整个闽东海域，只要是风平浪静、适合养殖的内湾，都能见到这种壮观的景象。根据宁德大黄鱼协会统计，目前闽东海域共有35万的养殖网箱，其中26万网箱养殖大黄鱼。殊不知正是蔚为壮观的“海上城市”，恶化了大黄鱼的养殖环境，使大黄鱼疾病丛生。从2000年以来，闽东海域每年都会出现大黄鱼大量死亡的惨况，不知打碎了多少养殖户的致富梦！
港口内湾养殖的局限性和种种弊端，成为制约闽东网箱养殖的瓶颈。要破解这个瓶颈，政府有关部门应该对闽东海域养殖进行全面的规划布局，发展深水养殖，将内湾养鱼网箱向外海转移，以减轻网箱养殖业对近海环境的污染。刘家富认为：“不发展深水网箱，闽东网箱养殖的路将会越走越窄！”
宁德目前的35万网箱，基本上都是传统的、适合浅水养殖的浮筏式网箱，不但受海岸线限制影响饲养面积，其抗风浪能力也不高。由于闽东台风过境频繁，养殖风险较大，养殖户常说：“在闽东养鱼，至少要逃过鱼病、台风这两劫才有可能赚钱！”发展深水网箱养殖，恰恰可以逃过这“两劫”。深水抗风浪网箱具有抗风力强、养殖容量大、效益高、养殖风险和养殖成本低等特点，而且养殖鱼类的成活率高，生长速度快，售价高，但目前整个闽东的深水网箱数量，不到传统网箱的零头。
深水养殖有诸多好处，为什么闽东的深水抗风浪网箱发展不快？宁德市水产技术推广站专家王承健这样解释：深水网箱养殖初期投入费用高昂，一组4口的深水网箱要50多万元，一般家庭经营养殖户难以承受；深水网箱养殖需要专门的养殖技术，没有接受专门培训，根本就不可能掌握。王承健认为，闽东内海湾养殖技术已经非常成熟，只是因为浅水海域污染严重，才频繁出现死鱼现象。目前当务之急是规范养殖秩序，按海水的自净能力清理网箱数目，同时对几千箱连片鱼排进行重新组合，按每200－300口网箱一组，采取鱼藻轮养、贝藻轮养的模式，这样才能缓解目前污染严重的情况。
霞浦县水技站站长江国强建议，对局部污染严重的浅水海域，应减少大黄鱼、鲈鱼等上游品种的养殖数量，发展梭子蟹和蛏子、牡蛎等中下游水产品种。海洋是一个生物链，上游鱼虾的剩余饵料和排泄物可以为下游贝类所吸纳，通过生物循环，实现海洋环境的平衡净化，如养殖海带、裙带菜、坛紫菜等大型经济海藻，既可以净化水体，又有较高的经济效益。霞浦如今已养殖成功具有“海水清道夫”美称的刺参，刺参吞食泥沙量很大，每只刺参每小时可吞食泥沙68克，一年就是50－70公斤，不仅能对养殖海域起到较好的净化作用，而且成品刺参价格每公斤100－120元左右，是大黄鱼的5倍之多。
发展轮殖也只是应急措施，长远之计还是向深海要空间。水产专家王承健建议采取渐进的方法，逐步发展深海养殖。据他介绍，目前三都澳养殖区的养殖户，已经发展出一种介于深水抗风浪网箱和浮筏式网箱之间的网箱，它网深9米，养殖技术和浮筏式网箱差不多，而且造价也不高，一口3万元左右，一般养殖户可以承受。这种网箱可以抗11级的风浪，2004年8月的台风“云娜”对这种网箱也没造成多大损害，20口网箱才破裂2口。关键是这种网箱可在10－14米等深线海域养殖，用这种网箱作为深水网箱的过渡，有其可行性。王承健说：“多离开海岸一米，闽东海水养殖业就向前跨出一大步！”
目前，宁德市正开展海上养殖专项治理工作，对海上网箱和大黄鱼育苗场进行普查登记、容量（总量）规划、确权发证，整顿治理不符合规划要求的网箱和育苗场，同时组建海上网箱养殖行业协会。同时，积极鼓励养殖户发展深水抗风浪大网箱，并按有关规定，给发展深水抗风浪大网箱的养殖户每组（4口）补助15万元。这些举措深受养殖户的欢迎，养殖户们期盼相关治理工作能够取得切实效果，使海上养殖业发展得更快更好。
