目前，美国仅核准六种药品为养殖可用药，包括麻醉剂、驱虫剂、催产激素各一种及三种抗生素，其中一种抗生素已经停产及使用。上述药品均须遵照标识使用。羟四环素、磺胺二甲氧嘧啶及欧美德普配制成的磺胺剂仅可用于特定鱼种以治疗鱼病，如羟四环素只能用于河鲶、鲑类及龙虾。上述抗生素仅可用于治疗鱼病，不可用于促进鱼体生长或预防疾病。
调查显示，美国国内出售抗生素用于养殖产业的剂量为5万至7万磅，该数值显示抗生素使用于养殖产业仅占0.3％～0.4％。少数科学文献认为美国国内养殖产业使用抗生素会对人类或环境造成伤害。由EPA核准的硫酸铜是一种化学除藻剂，亦可用于多种水产品抵抗寄生虫。使用硫酸铜时，需符合《美国净水法》的水质标准规范。
美国FDA禁止在进口动物源性食品中使用下列11种药物：氯霉素、呋喃西林、盐酸克伦特罗、呋喃唑酮、己烯雌酚、磺胺类药、二甲硝咪唑、氟乙酰苯醌和其他硝基咪唑类、糖肽、异烟酰咪唑。
按照水产品HACCP体系标准，进口水产品要同美国本土产品一样，需要实施HACCP体系控制。法规要求进口商对国外工厂进行验证，以确认其符合HACCP法规的要求。
