与会专家通过对项目立项依据、研究目标和价值、国内外研究现状和发展趋势、拟将解决的关键科学问题等内容再次激烈研讨，最终将项目定题为“科技引领淡水渔业、保持世界龙头地位——草鱼基因组计划及产业化”，由此，总投资5亿元人民币、有着“中国淡水鱼类863项目”之称的“草鱼基因组计划”项目自4月16日立项以来，历时3个多月，数易其稿，最终敲定。
该项目是具有中国特色的第一个淡水养殖鱼类基因计划，同时，首开了我国企业与政府共同投资进行国家级基因组研究项目的先河，并为科研成果与产业化紧密结合，及我国开展应用基础研究创造了全新的模式，将为指导和推广类似科研计划提供宝贵经验。作为与产业紧密结合的生物基因组计划，其工作重点是在绘制基因组序列和功能基因图谱的同时，进行各种产业化应用。项目总体研究内容包括草鱼基因组资源的开发和利用、转录组基因文库的构建、大批量基因的发展与鉴定、分子标记的开发与利用、遗传图谱及功能基因图谱的构建、全基因组测序、利用草鱼功能基因进行产业化研究和应用等。其中，功能基因图谱是本项目的核心。草鱼基因组的破译，将揭开代表中国淡水养殖70％、世界淡水养殖40％的鲤科鱼类的神秘面纱，有利于揭示整个鲤科鱼类基因组资源、分子遗传机理，从而对鱼病诊断技术、分子辅助育种、基因遗传资源利用、营养饲料开发等都将具有深远影响，对突破我国传统淡水养殖业技术瓶颈，稳定和确保我国粮食、食品安全，保持和巩固我国引领淡水鱼世界龙头地位，促进我国淡水渔业可持续发展，以及对抢救、保护、利用野生草鱼种群隐含的丰富遗传资源，维持整个生态平衡，具有重大现实意义和深远历史意义。
