博斯腾湖盛产鲫鱼、鲤鱼、鲢鱼、镛鱼、赤鲈、乌鳢、池沼公鱼等鱼类，２００４年通过了国家环保总局的"有机鱼"认证。随后，博斯腾湖水产品在市场上的竞争力显著提高，市场售价随之上涨。为了确保开发性捕捞博斯腾湖淡水鱼资源，博斯腾湖管理局对开都河草鱼、鲢鱼及扬水站围栏捕捞权进行公开拍卖，３０家从事捕捞的个体户参加竞拍。开都河草鱼、鲢鱼及扬水站围栏捕捞权最终被库尔勒市一家个体捕捞户以１０２．５万元和３０万元获取。
博斯腾湖是新疆最大的渔业生产基地，现有水域面积１６００多平方公里，年产各种鲜鱼６０００多吨，其中对水质要求较高的名贵鱼种池沼公鱼年产量就有２５００多吨，渔业发展潜力巨大。
博斯腾湖管理局局长李冰说，博斯腾湖具有适合多种鱼类生存繁殖的优良环境和发展天然绿色水产品所需的得天独厚的条件，其中池沼公鱼因肉质鲜美、无公害而受到日本人喜爱，每年出口日本２０００吨。
