代表欧盟，欧洲委员会同科摩罗岛伊斯兰共和国签署了始于2005年1月1日的为期6年的新协议。该协议是关于限制金枪鱼捕捞问题的，允许捕捞船只数从原有的65只降低到了57只，其中40只是金枪鱼围网渔船(数量没变)，17只多钩长线船(从25只减少到了17只)。每年的财政补偿从原有的350,250英镑增加到了390,000英镑，其中60%用来巩固可靠捕捞和科摩罗水域可持续发展的渔业。
另外，渔业船主所支付的许可证费用增加了50%，围网渔船需交付3,375英镑，多钩长线船需交付2,065英镑。但捕捞可能性和技术措施要与印度洋金枪鱼委员会(IOTC)的适当措施和最新科学建议一致。
这一协议标志着双边协议同合作协议的逐渐转变，合作协议着重强调帮助合作国在其水域建立责任渔业。在这一协议下作业的船只主要来自日本、法国和意大利。
