江西的洪涝灾害近几十年都比较罕见，菜地、水稻等农产品被淹。江西省统计局相关人员认为，洪灾影响主要有两个方面，首先会造成农产品大面积减收甚至绝收；其次，导致大批运输通道被摧毁，阻碍运输，从而导致农产品供应出现困难。该人士认为虽然灾情会对农产品价格造成影响，但不会太大。
虽然目前尚无法对洪灾损失以及造成的影响做出具体评估，但分析人士认为，水灾对处于南方的粮食加工类上市公司、养殖业上市公司将带来负面影响，由于补种农作物的需求增加，南方水灾对种业公司，特别是稻米类种业上市公司构成利好。
市场粮价方面，６月中旬，受洪涝灾害影响，福建部分铁路、公路运输受阻，短期内市场到货量有所减少，但由于市场库存充裕，经销商有意削减夏季库存，福州大米市场价格并未受到影响，部分品种价格还有小幅回落。
养殖业方面，肉鸡养殖龙头圣农发展近日称，公司所在地福建省光泽县遭遇百年一遇的水灾，该公司的多个鸡场进水受淹，遭受较大损失。经初步估计，其直接经济损失约３０００万元。
对此，分析人士认为，南方水灾对养殖业造成损失，比如鱼塘被冲毁，养猪场、养鸡场被淹等，会造成南方地区对饲料的需求下降，而饲料主要配料是豆粕，有可能造成豆粕价格下跌。
