但是生物燃料与食品安全的关系很复杂，需要谨慎评估。
全球谷物和油籽价格在过去一年中大幅上涨，原因各有不同。小麦价格在2008年1月到4月期间比上年同期涨了126%。但是在欧盟，只有1.4%的小麦产量用于生产生物燃料，在全球，这一比例也只有0.6%。因而生物燃料行业的小麦需求不可能直接导致食品价格上涨，小麦价格上涨更多是因为部分主产国天气恶劣，比如澳大利亚和乌克兰，这对价格的影响更大一些。
2007年7月到2008年3月期间玉米价格涨了23%，经过2006/07年度的45%涨幅后，这样的涨幅相对温和。在美国，2005/06年度到2007/08年度期间，乙醇行业的玉米用量预期增长了近一倍。2009年，美国乙醇行业的玉米用量将占到玉米总用量的38%，相当于1亿吨。国内乙醇行业迅猛发展，这与2007年新能源法案的推出有密切关系，这项法案规定了最低的生物燃料用量，因而生物燃料行业的玉米用量与玉米价格上涨有密切的关联。
油籽价格比上年涨了94%，比2006年涨了140%。生物燃料开始成为影响油籽价格的主要因素，其中一方面通过使用植物油生产生物燃料来影响油籽价格，另一方面，谷物用于生产生物燃料，这意味着谷物要跟油籽竞争耕地。这在欧盟可能尤其明显，欧盟是全球最大的生物燃料生产国。今年欧盟生物柴油行业的菜籽油用量可能占到全球总用量的8%，到2017年，这一比例可能达到41%。欧盟委员会计划到2020年将生物燃料掺混率提高到10%，这可能加大油籽市场的压力。
报告显示，随着人口增长，发展中国家经济发展，近来价格飙升已经不再受到食品需求增加等长期趋势的地，而是更多与农业行业长期存在的问题相关。
生物燃料增产一直是食品价格通货膨胀的一个驱动力量，对于特定谷物以及特定国家来说尤其如此。但是并不是主要因素。比如农产品歉收，生产力投资以及基础设施投入不足，农业市场扭曲、发展中国家的农业支持政策等长期因素才是目前食品危机的更确切因素。
长期因素再加上主产区天气恶劣（可能因气候变化）、能源价格大涨、部分出口国限制出口，这造成了极大的影响。另外，生物燃料与食品价格飙升的关系应当更多由政策失败来解释，而不是生物燃料生产本身的内在性以及不可避免的结果。
