8月16日国家粮食局下发通知，全面部署了2006年全国粮食库存检查工作。2006年全国粮食库存检查工作分自查、复查和抽查三个阶段进行。9月15日前，由各地、各有关部门和单位组织自查和复查，9月19日后国家发展改革委、国家粮食局、财政部和中国农业发展银行派出联合工作组进行抽查。国家粮食局就抽查工作制定了详细的方案。
今年抽查的范围包括部分粮食主产省以及2001年清仓查库以来抽查较少的10个省（区、市），抽查的企业主要是国有及国有控股粮食企业，抽查的重点是中央储备粮和地方储备粮库存，以及其它政策性粮食和商品粮。每个省抽查的粮食企业随机确定。检查时点为2006年8月底粮食库存。抽查的内容包括粮食库存实物数量、账务处理、质量、原粮卫生、储粮安全以及中央储备粮代储资格等方面内容。为提高粮食库存检查工作的效率，保证检查结果的真实准确，国家发改委、国家粮食局、财政部、中国农业发展银行等四部门和单位抽调了130人，组成10个联合工作组。9月15日-18日，联合工作组成员在北京集中进行了培训和考核。联合工作组出发前，国家粮食局领导同志做了动员，要求今年的库存检查抽查工作做到“精心组织，周密部署，随机抽查，掌握实情”。目前，联合工作组已赴抽查省份开展工作。抽查期间，当地发展改革委、财政、粮食部门以及农发行分行、中储粮分公司等将派相关人员协助联合工作组的工作，国家粮食局领导还将对各工作组抽查情况进行巡视检查。
抽查工作全部结束后，国家粮食局将及时汇总全国粮食库存检查情况，并会同有关部门和单位联合上报国务院。
