主持此次调查的张旭东教授认为，东北黑土有机质含量和质量下降的直接原因是掠夺式经营方式，以及长期采用不合理的耕作制度造成的。他说，黑土有机质含量下降及土壤结构破坏的一个严重后果是土壤抗蚀能力减弱，导致水土流失，而黑土退化已严重影响了黑土生产力的发挥和高效生产，主要表现为产量不稳、生产效益下降，对我国的粮食生产产生潜在的威胁。
由于对东北黑土资源的保护没有得到应有的重视，东北黑土土壤严重退化。中科院沈阳应用生态研究所调查显示，目前吉林省黑土层厚度在20厘米－30厘米的薄层黑土面积占黑土总面积25％，黑土层厚度小于20厘米的黑土面积占12％左右，完全丧失黑土层的“露黄”黑土面积占3％。而在历史上，自然黑土腐殖质层厚度一般应该在30厘米－70厘米左右。
