要根据每个猪场不同的情况来选择疫苗。灭活苗的安全性大大高于弱毒苗，而且不存在散毒的危险，然而再好的灭活苗的效果也不能和弱毒苗相比。 蓝耳病疫苗分两种，一种是灭活苗，另一种是弱毒苗。到底哪种效果好？应该在何时注射才能取得好的效果呢？
弱毒苗注入体内的效果与感染野毒没有多大差别。会同野毒一样穿过胎盘侵害胎儿。如果疫苗的基因序列与某一群体存在的蓝耳病病毒基因序列相似性达到70%～80%时，疫苗会比较有效。如果基因序列不同，则可能会引发一场新的蓝耳病到来。
灭活苗诱导有效免疫力的能力比较差，但在使用上是比较安全的，可以诱导一定的抗体产生，如果抗体与野毒的基因序列比较相似，会产生较好的保护，如果基因序列不相似，则保护力比较差。
因此，要根据每个猪场不同的情况来选择疫苗。灭活苗的安全性大大高于弱毒苗，而且不存在散毒的危险，然而再好的灭活苗的效果也不能和弱毒苗相比。所以对于种猪和阳性场应该选用灭活苗，而阴性场最好选用免疫效果好的弱毒疫苗。
