肉鸡后期最常见的就是病毒病和肠道病，但很多时候诊断的时候有所偏差，约有一大半的人认为后期就是防病毒，把后期的一切症状（比如拉稀、减料、死亡等）归为病毒的原因。
这些症状确实有可能是病毒造成，甚至很多时候可以说病毒脱不了干系，但也不能全归为病毒所致，病毒只是一个导火线而已。鸡群之所以拉稀、减料、死亡的直接原因也就是因为自身的抵抗力的下降，营养成分的匮乏或不平衡，使吸收和转化器管的功能缺失，导致外界病原的感染（或感染后的体内细菌的滋生致病）。
当饲养环境中存在病原的时候, 机体自身如果正处于免疫力低弱期就会给病毒一个趁虚而入的机会，这时候就形成感染。但是感染并不代表发病，因为机体还有一定的抵抗能力能和外来病原抗衡，一旦抵抗力小于外来病原感染力，这时候才会发病。由于没有抵抗力体质虚弱，故病毒细菌均可侵入致病！
当病毒和细菌同时感染时，群体就会表现快速发病混合感染，这时候做治疗就需要双管齐下。若病毒在先，则先表现为降料、绿粪、精神沉郁等偏向于病毒方面的症状，之后可见继发症状：心包炎、肝周炎、气管阻塞等，此阶段前期可以只治病毒提高机体抵抗力，到后期还得全方位治疗。另一种情况基本看不出病毒性症状，但大多时候都有死亡，解剖也仅表现肠道有些许病变，群体一般表现采食量降低，这样的鸡群病初体质并不虚弱，对症治疗即可，稍有发展（治疗不及时）则会和病毒混感，该症状肉鸡后期经常发生，都是治病毒没治好，反倒对症治疗收尾，有一定的死淘率。
治疗建议，加强饲养管理，不要忽视肠道病的治疗，后期有超过半数的死亡和生长缓慢都是因为肠道不好，除此之外要注重净化环境，即注意消毒，消毒要选高浓度高效产品，如复合碘。
药品选择依次为：病毒药（双黄连、禽感康、利克舒，当然，也可使用拌料的的鸡场也可选用欣感灵和扶正解毒散）、肠道药。如果群体状态不良，要注意解表成分药物的使用。
