青霉素类兽药用于动物肌体一般无不良反应，但对个别家畜偶见有过敏反应，严重的可产生过敏性休克。易过敏家畜以马、骡、猪、犬等多见，注射后不久出现流汗、兴奋不安、肌肉震颤、心跳加快、呼吸困难、站立不稳、抽搐等症状。因此，在用药过程中应注意观察，如出现过敏反应，应立即停止用药，同时，用肾上腺素或地塞米松进行抢救。
青霉素钾盐不宜静脉注射青霉素钾盐应肌肉注射，在使用时还应注意动物的血钾变化，一般禁止大量使用，特别对高血钾病畜禁用。
避免空腹时使用青霉素类兽药不宜在病畜空腹时注射，以免引起昏厥。
不可随意加大剂量大剂量或超大剂量使用青霉素类兽药，可干扰凝血机制而造成出血或引起中枢神经系统中毒，引起动物抽搐、大小便失禁，甚至瘫痪等症状。也可使耐药菌迅速诱导产生分解青霉素的β-内酰胺酶。
青霉素类兽药应即溶即用由于青霉素类药物的水溶液不稳定，在室温下溶解的时间越长，其效价就越低，致敏物质也不断增加。所以应做到即溶即用，以确保药效。
注意配伍禁忌磺胺类钠盐与青霉素混合，会使青霉素失效;青霉素与庆大霉素合用，会使庆大霉素失效;青霉素与四环素、氯霉素、碳酸氢钠、维生素C、阿托品、氯丙嗪等混合使用，也会失效。
