美国专家认为，发生仔猪下痢不简单是疾病的问题，很大程度上存在着管理因素。
采集病料要以发病急、未经过治疗且还未死亡的病猪最好，不能送那些有问题、已治疗和已死亡的猪只。
采集病料时要先采集外观。尽管下痢明显，但还要观看其它组织是否有病变。对大肠杆菌引起的下痢，有可能在肺内找到病原，送病料时最好带上肺气管；然后看关节是否有脓肿和积液，如果有则可能是链球菌问题。
取病料时，大肠、小肠要分开取，荚膜梭菌在小肠可以检测，但在大肠就检测不到，大肠水肿是造成下痢的常见症状；对胃内容物的检测，要考虑是否含有梭菌，仔猪7日龄后发生的下痢，很可能是球虫引起，应进行漂浮试验。
轮状病毒分为A、B、C型，目前的PCR方法检测不出A、C型，但组织病理学可发现B型，从而予以确诊。当春季小猪发生顽固性下痢、抗生素治疗无效、怀疑是轮状病毒（鉴别不是传染性胃肠炎）时，可采用病猪的粪便、小肠病料返饲母猪的办法来解决。
