据报道，美国疾病控制和预防中心(CDC)研究人员于2009年至2010年间，在危地马拉两个地点收集了316只活果蝠，以调查狂犬病的传染，结果在其中3只蝙蝠肠内意外发现了甲流病毒。这种果蝠是中南美洲的特有品种，主要进食水果及昆虫，通常不会咬人。不过人类若被咬到，仍有机会受感染。
美国疾病控制和预防中心辖下的病原体发现中心华裔主管唐素湘称，虽然病毒现在不会威胁人类，但发现新传播媒介是重要一步。专家担心，假如病毒与常见流感病毒结合，可能造成基因洗牌，变成更危险的病毒，导致人与人之间的传染。
不过也有学者质疑研究的可信性，认为CDC的科学家只利用实验室技术找到流感病毒的基因碎片，然后将成果夸大。密歇根州立大学禽鸟疾病专家富尔顿表示，研究员应扩大抽样范围，并尝试用病毒感染其他品种的蝙蝠，甚至其他动物。他说，“如果你不能培养病毒，如何能确定病毒存在？”
