管理办法明确，生猪调出大县坚持“引导生产、多调多奖、直拨到县、专项使用”的原则，主要以统计系统公开发布的分县分年数据为基础，对统计数据达到规定标准的县予以奖励。对达不到规定标准，但对区域内的生猪生产和猪肉供应起着重大影响作用的县（如36个大中城市周边的产猪大县），可以纳入奖励范围。
为更大调动生猪非主产省及西部省区发展生猪生产能力，财政部对年度奖励资金总规模的10%，综合考虑各省(自治区、直辖市、计划单列市）县级区划数和上年生猪调出大县个数，按因素法切块给地方，由各省(自治区、直辖市、计划单列市）自主安排到对本省(自治区、直辖市、计划单列市）生猪生产和猪肉供应起重要作用的大县。
财政部根据每年地方报送数据确定生猪调出大县，按生猪调出量、出栏量和存栏量及所占权重分别为50%、25%、25%的因素计算，将切块后的90%奖励资金直接分配到县。分县的生猪出栏量、存栏量按前3年的数据进行算术平均。调出量按生猪出栏量扣除当地生猪消费量计算。
奖励资金实行专款专用，用途如下：（一）规模化生猪养殖户（场）猪舍改造、良种引进、粪污处理的支出；（二）生猪养殖大户购买种公猪、母猪、仔猪和饲料等的贷款贴息和保险保费补助支出；（三）生猪流通和加工方面的贷款贴息支出；（四）生猪防疫服务费用支出，要严格控制支出规模和范围；（五）经财政部批准的其他支出。
生猪调出大县奖励资金通过专项转移支付拨付到省级财政。省级财政在收到奖励资金后，对自主安排的切块资金，要商省级畜牧（或农业）等部门，抓紧制定分配方案，尽快落实到具体的县；对财政部直接分配到县的奖励资金，必须在10个工作日内拨付到县级财政，不得滞留、截留和挪用。
