1 缺乏长远的育种眼光和有效的组织 长期以来中国的猪育种工作大多以科研项目的形式进行于缺乏与市场直接联系的经济实体，未获得相应的经济回报。只有直接从事养猪生产的企业，甚至专业的育种公司才有可能组织结构合理的繁育体系，内部协调好各功能群体经营者的利益，建立有效的育种体系。
2 缺乏系统、持久的育种规划 猪育种工作的长期性和艰巨性是众所周知的，在缺乏长远利益眼光和结构完善的繁育体系情况下是难以长期执行有效的育种规划的。
3 缺乏牢固的基础性育种工作 猪育种依赖于长期坚持不懈的性能测定，需要积累大量有效的育种数据记录，这是制约我国猪育种工作的决定性因素。长期以来由于养猪生产的小农经济模式，经营规模有限，难以开展具有商品生产价值的育种工作，缺乏有效的育种措施,基本育种资料记录系统也不完善，基层种猪场技术力量不足、水平不高。
