农业部检查组指出，上海市对重大动物疫病秋防工作思想重视、组织有序、措施得力、成效明显，确保了上海世博会期间没有发生重大动物疫情和重大动物产品质量安全事件。
分析总结上海的做法，主要体现在七个方面：一是组织领导坚强有力。上海市各级政府高度重视重大动物疫病防控工作，将其摆在重要议事日程，严格落实责任，为秋防工作顺利开展提供了切实保障。二是免疫工作规范开展。严格贯彻“应免尽免，不留空当”的要求，积极开展秋季集中免疫大会战和日常补免补防工作，免疫工作实现制度化、规范化、科学化。三是疫情监测有序开展。上海对种畜禽场、活禽交易市场、野鸟栖息地等重点场所以及口蹄疫、禽流感等重点疫病的监测力度大、范围广、数量多、频次高，并能及时完成农业部布置的狂犬病等疫病的专项流行病学调查工作。四是资金投入力度加大。市、区县两级财政在补助强制免疫用疫苗、散养畜禽免疫注射费的基础上，今年上海市财政又追加了肉猪口蹄疫三免的专项资金，切实保障了强制免疫疫苗的足额到位。五是应急能力不断提高。上海应急预案完善、应急物资充足、应急队伍齐整、应急演练有序，在思想上、行动上、能力上都对应急事件做好了充分准备。六是队伍建设得到强化。上海市农委印发了《关于加强本市基层农业技术推广、动植物疫病防控、农产品质量监管队伍建设的指导意见》，对基层动物防疫队伍岗位职责、人员聘用、培训教育、财政保障等提出了进一步的要求。七是督促检查强力推进。上海市农委邵林初副主任亲自带队，组织开展全市秋季重大动物疫病防控工作，对督查中发现的问题能及时整改，消除隐患，确保各个防控环节不出纰漏。
检查组在肯定工作的同时，对上海下阶段重大动物疫病防控工作提出了两点建议：一是进一步改善中小规模养殖场防疫条件。积极推进畜禽养殖场标准化改造和建设，加大财政投入力度，加快全市畜牧业标准化建设的速度，不断改善和提高防疫条件。二是进一步加强基层动物防疫机构和队伍。按照农业部要求，进一步完善乡镇畜牧兽医站和村级防疫队伍的建设方案，加强基层动物防疫机构和队伍建设，从根本上稳定基层动物防疫队伍，提高防疫人员的工作积极性。
