据北京市农业局局长赵根武介绍，北京市动物卫生与畜牧管理三大体系建设的主要内容包括：以宣传为基础、评价为核心、社会公示和重点监管为手段，加强动物卫生社会责任体系建设；以分类管理为基础、标准化运行为核心、移动监管为手段，加强动物卫生标准化监管体系建设；以日常考评为基础、综合评价为核心、结果应用为手段，加强机构效能评估体系建设。
近年来，国内外动物疫情形势严峻，高致病性禽流感、疯牛病等重大动物疫病不断蔓延扩散，而北京市所需60％的动物产品、85％的水产品来自外埠，疫情传入风险高，食品安全监管难度大。
根据2009年初发布的《北京市动物防疫体系建设规划》，几年内，北京市将投资7.6亿多元用于动物防疫体系基础设施建设。到2012年，北京市将具备对主要动物疫病进行病原学和血清学检测的能力，具备对兽药及有害物残留进行检测的能力。一旦周边省份发生重大动物疫情，北京市在27个进京路口设立的动物防疫监督检查站将在24小时内启动应急防堵机制。
据北京市防治重大动物疫病指挥部介绍，连续五年来，北京地区未发生高致病性禽流感、疯牛病等重大动物疫病区域性疫情。
