农业部和甘肃省动物防疫工作组和专家组经过长途跋涉进入舟曲县城受灾现场后，立即开展救灾工作。
一是根据受灾情况，及时与甘肃省救灾指挥部沟通，提出预警建议，将消毒和死亡动物无害化处理工作列入救灾工作日程，确保农牧系统救灾相关人员、物资的交通通畅。舟曲县农牧系统组成9个党员突击队，兽医专业技术人员59名，出动300多人次开展消毒灭源工作，每天环境消毒面积达2平方公里，
二是工作组和专家组随车运入灾区的防疫物资移交当地兽医部门，并看望慰问奋战在救灾一线农牧系统职工。同时，协调周边地区做好防疫物资调拨准备工作，保证工作需要。截止目前，已动用甘肃省应急防疫物资消毒药品16.5吨，消毒器械5000多台（套、件）。
三是制定舟曲县灾后死亡动物无害化处理工作方案，现场指导动物尸体无害化处理细节工作。指导工作人员合理分组、设置明确的“动物尸体无害化处理”标识、与其它救援队伍协同工作。当地兽医部门组织了多个消毒和动物尸体处理小组在现场开展消毒灭源工作。根据灾区地理位置的特殊性，选择了3处动物尸体无害化处理点，指定人员守在每一台清淤挖掘机旁，按照“发现一头处理一头”的要求，对清理出来的死亡动物尸体，及时彻底消毒后无害化处理。
四是指导舟曲县周边市县动物卫生监督部门对工作做出部署，要求加强对周边各交通要道的动物及动物产品监管。组织州、县兽医人员开展环境消毒工作，做好舆论宣传，要求群众不食用、不贩运死亡动物。
五是指导开展白龙江下游流域死亡动物尸体的打捞和无害化处理工作，加强灾区周边疫情监测，防止大灾之后出现重大动物疫情和人畜共患病疫情。
目前，灾害发生已超过120小时，加之天气炎热，动物尸体开始腐败。由于灾区空间狭小，开展死亡畜禽尸体清理、无害化处理工作困难很大。几天来，工作组、专家组和当地兽医部门的同志，一边忍受着巨大的悲痛，一边忍受着高温环境，持续作战。当地兽医部门部分职工家里受灾严重，顾不上处理，甚至亲人遇难仍坚守救灾工作岗位。舟曲县种子站职工韩彦成和农经站职工韩更成兄弟俩，亲属8人遇难，仍一直奋战在救灾一线。正是这种“舍小家、为大家”的精神鼓舞着灾区群众，大家不怕苦、不怕累，克服种种困难，努力实现“大灾之后无大疫”的目标。
