据介绍，该研究项目共分4个课题，包括禽流感病毒分子流行病学和病毒进化变异规律、禽流感病毒主要蛋白的结构与功能研究、人感染禽流感病毒机制研究及禽流感病毒感染的免疫应答和免疫保护机制研究，由中国科学院微生物研究所高福研究员主持。
历经4年研究，课题组阐明了近年来流感病毒在多种动物和人中的分子流行病学特征与进化变异规律；解析了H5N1病毒RNA聚合酶部分亚基的结构，为抗流感病毒药物设计提供了潜在的新靶点；首次报道了流感病毒感染引起人肺上皮细胞自噬，发现自噬抑制剂可以抑制流感病毒的复制；鉴定了第一个具有生物学功能的H5N1病毒CTL表位；设计和筛选出一种能抑制流感病毒膜融合的多肽抑制剂；发现了H5N1病毒可以通过胎盘进行母婴传播，人肠道细胞存在禽流感病毒α-2，3半乳糖苷唾液酸受体。
该项目共发表论文49篇，其中2篇发表于国际知名杂志《自然》，1篇发表于《柳叶刀》。共申请专利13项，其中国际专利1项。
