据统计，在全国农产品质量安全整治活动中，各地共出动执法人员283万人次，检查生产经营企业163万家，共查出问题5.4万余起，责令整改4.7万起，立案查处重大案件64起，移送司法机关37人，逮捕31人，取缔无证照企业1114家，吊销营业执照588个。
农产品质量安全水平趋稳向好。从农业部组织的例行监测结果看，按往年同期同口径统计，2009年蔬菜、畜禽产品和水产品合格率分别为96.4%、99.5%和97.2%，与2008年相比分别提高了0.1、0.8和1.5个百分点，新增监测的水果、食用菌和茶叶合格率分别为98%、95.2%和94.8%。从专项监测结果看，无公害生产及出口创建基地蔬菜、水果、茶叶农药残留监测合格率为98.7%；水产品产地监督抽查合格率达到97.8%；组织监测生鲜乳样品13129批次，三聚氰胺含量全部符合临时管理限量值规定；无公害农产品、绿色食品、有机农产品的抽检合格率分别为99.1%、98.8%、100%。
体系建设步伐显著加快。目前已有20个省级农业部门成立了农产品质量安全专门监管机构，并正向市县基层延伸；加大质检体系投资建设力度，落实中央投资8亿元，建设质检机构451个，建设总数达到507个；加大综合执法投入，提高基层农业综合执法能力；新制定发布农业标准511项；新认证“三品”1.7万多个，新登记保护地理标志农产品81个。
质量安全监管机制不断完善。制定了《生鲜乳收购站标准化管理技术规范》，实行生鲜乳收购站准入制度；出台了《无公害农产品质量安全风险预警管理规范》、《绿色食品质量安全预警信息收集与上报规范》和《关于有机农产品风险预警及应急处理办法》等文件，积极推进无公害农产品、绿色食品和有机农产品监管工作制度化、规范化；积极开展兽药GSP试点工作，改善经营环境，加强质量管理，强化购进兽药的合法性审查。建立兽药专项整治行动与行政执法联动制度，发现违法违规行为，依法立案查处，兽药市场得到有效净化。发布了《农垦农产品质量追溯标识管理办法》，完善农产品质量追溯项目管理制度，着力构建农产品质量追溯工作制度体系。
全年未发生重大农产品质量安全事件。经过各级农业部门的共同努力，将全国75万家主要农产品、投入品生产经营企业纳入专项整治范围，强化监管工作措施，始终保持高压态势，农产品质量安全突出问题得到进一步解决，违法违规使用禁用药物及有毒有害物质行为得到有效遏制。借鉴“助奥行动”成功经验，加强沟通协调，开展督查检查，实行联防联控，确保了60周年国庆和第十一届全运会期间农产品充足供应、质量安全。
