在境外出现人感染甲型Ｈ１Ｎ１流感疫情后，中国农业部立即组织国家禽流感参考实验室、中国动物卫生与流行病学中心等单位专家成立猪感染甲型Ｈ１Ｎ１病毒防控专家组，研制开发快速有效的诊断试剂，做好技术储备。
５月３日，中国农业部发布消息称，专家联合攻关已成功研制出猪感染甲型Ｈ１Ｎ１病毒ＲＴ—ＰＣＲ检测试剂盒，可在５小时内完成 今日国内聚焦
病毒快速检测。这一方法敏感性高、特异性强，不仅适用于猪感染甲型Ｈ１Ｎ１病毒的检测，对诊断人感染甲型Ｈ１Ｎ１流感病毒也有较高的参考价值。
在中国科学院，防控甲型Ｈ１Ｎ１流感疫情已成为当前的重点工作。中科院生命科学与生物技术局局长张知彬说，经过紧急动员和部署，中科院分布在全国各地的十多家相关科研机构正在开展科研攻关，研究方向涉及疫情预警评估、快速诊断检测、药物储备和筛选、病毒溯源和跨种传播、疫苗研发、国际国内组织及企业合作、信息和科普宣传等。
此外，中科院还决定以这次疫情为契机，推动建设“重大传染病与生物安全网络中心和生物安全实验室”。
中法共建的中科院上海巴斯德研究所以法国著名微生物学家巴斯德命名，研究强项是包括流感在内的重大传染性疾病。所长杜文圣说，快速诊断是巴斯德研究所的重点攻关对象，针对甲型Ｈ１Ｎ１流感病毒的特点，科研人员已设计了多种快速诊断技术。
在核酸检测方面，他们设计了基于不同流感病毒的多重ＰＣＲ技术用于该病毒的鉴别诊断。在抗原检测方面，科研人员则设计研发了两种胶体金检测产品——一种为感染早期对病毒蛋白的检测，另一种为感染中后期针对病毒蛋白特异性抗体的检测。
巴斯德研究所的疫苗研制工作也有所收获。科学家们建立和完善了一个可用于高效快速表达疫苗和抗体的单载体复制子表达体系，成功地高水平表达了多个疫苗抗原并证实其免疫活性，并且初步建立一个有效的后加工程序，可作为快速开发甲型Ｈ１Ｎ１流感病毒疫苗的一个新途径。
曾成功研发抗非典药物、抗禽流感药物的中科院上海药物研究所，又投入到了研发抗甲型Ｈ１Ｎ１流感病毒药物的攻关之中。所长丁健告诉记者，这个研究所已经成立了药物研究攻关协作组，下设生物信息和药物设计组、化合物产生研究组、抗流感药物筛选组和病毒组４个小组。
目前，上海药物研究所正在成功研发抗禽流感药物达菲和扎那米韦（目前两种对甲型Ｈ１Ｎ１流感有治疗效果的药物）的基础上，进行抗甲型Ｈ１Ｎ１流感药物储备；同时进行新类似物和新剂型研究，快速获得新型抗甲型Ｈ１Ｎ１流感药物。
担任攻关组组长的上海药物研究所副所长蒋华良说，攻关组已经确定将“建立抗甲型Ｈ１Ｎ１流感药物筛选模型”“抗甲型Ｈ１Ｎ１流感化合物的设计、大规模合成和提取”和“甲型Ｈ１Ｎ１流感感染机制研究”作为攻关重点，并制定了研究计划。
