专项整治行动的任务和重点是，严格活禽经营市场动物防疫条件监管，做到活禽交易区与市场其他区域相对隔离，水禽与其他家禽分开，宰杀间与活禽存放区域隔离，宰杀间与出售场地分开；加大活禽经营市场监督检查力度，严厉查处经营病死禽及其产品的行为，监督做好病死禽及死因不明禽类的无害化处理工作；加强活禽经营市场监测工作，对重点活禽经营市场要每周监测一次；完善活禽经营市场禽流感防控应急预案，要对辖区内所有活禽经营市场进行建档立案，掌握每个活禽经营市场的基本情况。
专项整治工作分为四个阶段，3月下旬至4月中旬，地方各级兽医主管部门开展自检自查工作；4月中下旬，农业部将对部分省份进行督导检查；5月上旬，国家工商总局、农业部、卫生部、国家林业局将组成联合督查组对部分省份进行督导检查；5月中下旬，地方各级兽医主管部门对专项整治工作进行总结，提出相关意见和建议，制定下一步工作措施。
