自然养猪，把猪的粪尿处理当做非常重要的大事，因为猪的粪尿能在猪舍内变为饲料，猪舍使用3～5年也不用清除粪尿。即使不清除，粪尿也会越来越少，等到生猪出栏时，还必须补充相当一部分的垫料。自然养猪圈内几乎没有让人捂鼻以及致人眩晕的臭味。没有蛆蝇。因猪群很安静，不用担心由于养猪而产生的噪音影响邻里。猪粪是微生物的良好食物，以猪粪为食物的微生物，源源不断地繁殖，使猪舍圈面的微生物种类更加丰富。
猪的粪尿靠土著微生物的作用转换为饲料，为人类和自然的共存共荣打下了基础。所以，自然养猪不像工厂化养猪，不需要粪尿处理方面的耗资。更有意思的是猪舍的粪便越陈，猪生长发育的就越快，猪肉的品质也越好。这就同深山老林里茂盛的森林，时间越久，地力越强，树木也就越长越苍翠是一个道理。
