三鹿牌婴幼儿配方奶粉三聚氰胺污染事件发生后，农业部迅速部署相关工作，要求各地农牧部门迅速成立生鲜牛奶质量专项检查工作小组，逐级落实农产品质量安全属地管理责任，明确工作制度，确保工作到位、人员到位、措施到位，确保专项检查任务按时完成，杜绝不合格生鲜牛奶流入市场。
农业部将加大对标准化奶牛养殖小区（场）和机械化挤奶站的管理力度，引导养殖户集中饲养，加强养殖环节的技术培训，推行标准化规模养殖模式。严格按照畜牧法的要求，所有规模养殖场（小区）都要建立投入品记录和动物疫病治疗记录。严禁使用和添加国家明令禁用药品，严格执行休药期。奶牛养殖小区和养殖场要设立奶源质量管理监督员，负责奶源管理、奶站监督工作，坚决打击生鲜牛奶掺假制假的违法行为。
农业部要求，各地畜牧饲料主管部门要对辖区内的奶牛饲料生产企业和奶牛养殖场（小区）自配料进行全面检查，杜绝在饲料中添加违禁药物和有害化学物质。各饲料生产企业要严格落实生产记录、产品留样观察和可追溯制度，保证饲料产品质量安全。对非法生产、经营和添加违禁药物和有害化学物质的企业，要依据《饲料和饲料添加剂管理条例》，坚决打击，严厉查处。
