此次检查工作分自查和抽查两种方式。自查内容包括：按照《深圳市主要农产品生产基地认定与管理暂行办法》要求，检查已认定供深圳生产基地是否完全具备基地认定条件，是否符合认定程序，检查基地认定申请表（含申请单位基本情况、生产基地情况、生产基地认定评审情况）的内容是否真实准确，检查生产基地用地证明、无公害农产品产地证明、产品购销合同、基地建设协议、基地认定证书等相关材料是否完备；督促生产基地做好养殖记录，建立健全产品质量管理制度，确保供深圳产品达到无公害食品标准，并按规定比例完成产品供深圳任务；检查政府扶持资金使用情况。
抽查内容包括：听取被检查单位的汇报；检查基地生产档案记录和基地管理制度和无公害生产控制措施；检查生产基地生产情况和生产规模；核实生产基地出栏数量和申报供深圳数量是否一致；基地建设协议履行情况，基地扶持资金使用情况；对生产基地使用的饲料进行随机抽样，重点检测是否含有盐酸克伦特罗、莱克多巴胺等违禁药物。
