2007年，全国禽流感、口蹄疫疫情继续保持稳中有降态势，仅发生3起家禽禽流感疫情，未发生候鸟疫情，禽流感疫情起数、疫情范围、疫情规模比前几年明显下降。口蹄疫疫情大幅下降。通过采取免疫、监测、扑杀、检疫监管等各项防控措施，全国高致病性猪蓝耳病防控取得积极成效，西藏小反刍兽疫疫情得到有效控制，减少了农牧民的损失，促进了生猪生产恢复。
进一步加大免疫工作力度。组织制定了禽流感等重大动物疫病免疫方案，在重点抓好全国春秋两季集中免疫基础上，指导各地做好日常免疫，确保免疫密度，提高免疫抗体水平。2007年，全国共使用禽流感疫苗137亿羽份，口蹄疫疫苗27亿毫升，免疫密度保持在90%左右，抗体合格率超过80%，有效防止了疫情发生。
强化疫情监测和报告工作。组织制定了禽流感等重大动物疫病监测方案和流行病学调查方案，开展定时定点流行病学调查和监测工作。2007年1月至10月，全国共监测禽流感样品357万份，口蹄疫样品108万份，对免疫抗体低的及时补免，对病原学阳性畜禽按规定及时处置。
完善应急防控机制。加强养殖场综合防疫管理，加强动物卫生监督执法，强化科技支撑。组织各地指导规模养殖场、养殖小区建立免疫、卫生消毒、病死畜禽和粪污无害化处理等防疫制度，实行封闭管理，规范养殖行为；加强产地检疫和屠宰检疫，加强流通环节检疫监管，发现可疑疫情，按规定做好疫情确认和处理工作。
大力推进兽医管理体制改革。目前全国31个省份均已完成省级兽医工作机构改革，全国67％的地市和45％的县级机构改革也已完成，15个省份乡镇站改革基本完成，为防控工作提供坚强的组织保障。
